Кафедра была сформирована в 2000 году. Первым заведующим кафедрой стал доцент, кандидат медицинских наук Сергей Михайлович Куфтерин. В первый год кафедра объединила в себе два направления подготовки специалистов: по адаптивной физической культуре и основам безопасности жизнедеятельности (АФК и БЖД). Под руководством Сергея Михайловича на кафедре был сформирован коллектив из высококвалифицированных преподавателей: Щепина З.П., Пенигина И.В., Першина В.П., Пензина Е.Г., Кожевникова В.Ф., Погудин С.С. и др.

В последующем произошла реорганизация кафедры АФК и БЖД, в результате чего она разделилась на две самостоятельные: кафедру «Теории и методики БЖД», которую возглавил ст. преподаватель Пензин Е.Г. и кафедру «Теории и методики АФК», руководство которой продолжал осуществлять Сергей Михайлович Куфтерин.

Первый набор абитуриентов проходил в 1999 году на заочное отделение - это был самый большой набор студентов на базе среднего медицинского образования за весь период существования кафедры. Именно с первого набора пошло становление и развитие адаптивной физической культуры, как в институте, так и в городе. С 2000 года студентов проводился уже на два отделения - заочное и дневное.

С сентября 2008 г. по февраль 2010 года обязанности заведующего кафедрой «ТиМ АФК» исполнял доцент, кандидат медицинских наук Ардашев Александр Евгеньевич.

С марта 2010 года по февраль 2011 года кафедрой руководила старший преподаватель Ирина Сергеевна Мальцева, выпускница самого первого набора студентов.

В феврале 2011 года кафедру возглавил доцент, кандидат медицинских наук Паутов Эдуард Сергеевич и руководит ею по настоящее время.

В связи с переходом на двухуровневую систему образования в сентябре 2011 года кафедра Тим АФК была объединена с кафедрой медико-биологических дисциплин и обрела новое название – кафедра адаптивной физической культуры и медико-биологических дисциплин (АФК и МБД).

Кафедра МБД существовала с момента основания филиала Челябинского государственного института физической культуры (1980 г.). Первым заведующим кафедрой с 1980 по 1987 г. был к.м.н., доцент Константин Иванович Ханжин.

С 1987 по 1997 г. кафедрой МБД заведовал к.х.н., доцент Юрий Григорьевич Прасолов, который работал в ЧГАФКиС со дня основания в 1980 г. по 2001 г. С 1997 по 2006 г. обязанности заведующей кафедрой выполняла к.б.н., доцент Елизавета Сергеевна Бороненкова. С 2006 года по 2011 год эту должность занимала к.б.н., доцент Наталья Юрьевна Лаврова.

С 2023 года кафедра готовит бакалавров по профилю физическая реабилитация. Подготовка осуществляется по очной и заочной формам обучения.

Помимо бакалавров кафедра активно занимается подготовкой аспирантов по специальности 13.00.04. При этом ведется большая работа по привлечению в ряды аспирантов выпускников нашей кафедры.